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女性免疫不好不治疗，有可能会影响到胚胎着床的。一般在做试管婴儿之前都会检查女性的免疫，若是女性体内的免疫异常，如抗精子抗体、抗子宫内膜抗体、抗心磷脂抗体等有问题的话，就会影响到胚胎的正常着床，从而出现胚胎着床失败的情况，即使是胚胎成功着床了，也特别容易会出现流产、胎停等情况。因此，在试管前治疗免疫是非常有必要的，建议女性免疫治愈后再做试管移植手术，避免对试管移植胚胎着床造成影响。
若女性自身免疫系统防御功能发生异常，则会导致一系列免疫病理过程，包其中包括感染、免疫缺陷、自身免疫性疾病以及肿瘤等的发生，这不仅会使其难以受孕，还极易引发流产。此外，如果女性有抗心磷脂抗体，它会与血管壁上的磷脂结合，破坏血管内皮形成血栓，导致局部组织血供障碍，血供减少，易造成胚胎着床不牢固，导致流产。由此可见，女性免疫不好不治疗，确实会影响胚胎着床。
如果女性体内出现免疫异常，不进行治疗的话，是会影响胚胎着床的，从而导致试管移植失败。当然其他原因也会影响到胚胎着床，比如输卵管阻塞、排卵功能障碍、子宫畸形等。不过正常情况下，在做试管婴儿之前，医生都会检查免疫因子，检查结果如果是免疫异常，都会建议女性先治疗，治愈后再做试管移植手术，这也是为了提高试管婴儿的移植成功率。
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