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亲子鉴定的主要依据是遗传物质的稳定性，在遗传的过程中，亲代和子代之间的遗传物质很大程度上是一致的。亲子鉴定是利用生物学和遗传学的手段提取亲子之间的遗传物质染色体，再根据染色体上ＤＮＡ的核苷酸序列进行比对，当序列的同源性达到一定的高度，即可证明亲代与子代之间的亲缘关系。
亲子鉴定具体做法
１、DNA提取：对样品进行提取DNA，取出蛋白质对提取产物进一步纯化。
２、PCR扩增：对提取到的PCR按一定的量加入一定的模板，引物，底物等试剂液放入PCR仪中进行扩增，使提取的DNA浓度增加，便于检测。
３、毛细管测序仪检测：不同大小的DNA片段在电压作用下泳动的速度距离不同，所以在结果中可以看到多条条带，对于符合原本大小的条带进行回收或直接送测序。
4、数据分析，出具结果：检测人员根据结果进行分析汇总，计算，最后出鉴定结果。
亲缘关系的鉴定
1、常规的亲生血缘关系鉴定：父母与孩子。
2、隔代亲缘关系鉴定：祖父母与孙子孙女等。
3、疑难的亲缘关系鉴定:叔侄，表兄弟等等。
亲子鉴定费用如下
亲子鉴定大致可分为个人隐私亲子鉴定、司法亲子鉴定和胎儿亲子鉴定。三种鉴定类型，费用不止三种，但其收费方式差不多，简单介绍三种如下：
按检材数量收费。这是很多亲子鉴定机构的收费方式，按照检材的数量多少进行收费，一般为800-1000元/人。亲子鉴定最少是两个人，也就是“嫌疑父亲(或母亲)”与孩子，有的是三个人父、母、子，费用就是单个检材费用乘以人数。
按照鉴定类型收费。首先鉴定类型分司法鉴定和非司法鉴定，一般司法鉴定费用在3000元左右，非司法鉴定在2400元左右。然后又可以细分为单亲亲子鉴定和三联体亲子鉴定，当然各地会有所差异，但是差别不大。
按照样本难度进行收费。样本分为常规样本和特殊样本，常规样本指血液、血痕、毛发、口腔拭纸，其他都是特殊样本，比如指甲、嚼过的口香糖、烟头、鼻血、精斑条等等。常规样本一个为800-1000元/人，特殊样本会稍高一些。
